RII - KisSplice : Assemblage local de transcriptomes
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RII - KisSplice : Assemblage local de transcriptomes
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Titre :
RII - KisSplice : Assemblage local de transcriptomes
Légende - Résumé :
KisSplice est un logiciel qui permet d'analyser des données RNAseq avec ou sans génome de référence. C'est un assembleur local de transcriptome. Il permet d'identifier des SNPs, des indels et des événements d'épissage alternatif. Il permet de traiter plusieurs conditions expérimentales, et ainsi quantifier chaque variant dans chaque condition. Il a de très bonnes performances mémoire (5Go pour 100M lectures).
Rencontre Inria-Industrie : Bio-informatique et outils numériques pour les produits de santé - Lyon, 11 février 2014
