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Titre :
RII - Bonsai : Logiciels pour le séquençage haut débit et les peptides non-ribosomiques.
Légende - Résumé :
L’équipe de bio-informatique Bonsai développe une offre logicielle complète pour l’analyse de données de séquençage à haut-débit : mapping, RNA-seq, DNA-seq, métagénomique, métatranscriptome, quantification de recombinaisons lymphocytaires. Bonsai propose également une ressource unique dédiée aux peptides non-ribosomiques : Norine.
Norine comprend une base de données et des outils d'analyse qui facilitent la découverte de nouveaux peptides et médicaments potentiels. La pénicilline et l'anti-cancéreux actinomycine sont des exemples connus de PNR déjà commercialisés avec succès.

Rencontre Inria-Industrie : Bio-informatique et outils numériques pour les produits de santé - Lyon, 11 février 2014
Nom de fichier :
Inria_853_RII_BioInfo_Bonsai-FR
Titre :
RII - Bonsai : Logiciels pour le séquençage haut débit et les peptides non-ribosomiques.
Année :
2014
Durée (min) :
00:01:33
Publications :
https://videotheque.inria.fr/videotheque/doc/853
Autres versions :
Master VF : 853
Master VEN :
Autre : Lien externe :
Lien Equipe-projet :
Lien Centre de Recherche :
Mots clés :
N° master :
853
Durée :
01 min 33 sec
IsyTag :
analyse - blanc - Bonsaï - clone - différent - européen - globule - lymphocytes - Vidjil
Transcription automatiqu :
L'équipe de recherche Bonsaï est spécialisée dans l'analyse des séquences biologiques à haut débit
C'est Mathieu Giraud chercheur dans l'équipe Bonsaï qui nous présente Vidjil un logiciel d'analyse des lymphocytes En collaboration avec l'hôpital de Lille et avec d'autres laboratoires français et européens nous avons développé Vidjil un logiciel d'analyse des lymphocytes Ce projet consiste à analyser les globules blancs en particulier pour le suivi de la leucémie
Les globules blancs en temps normal sont tous différents Ils ont tous un code ADN différent ce qui est représenté ici sur l'image Un globule blanc peut être par exemple V7-D1-J3
ou V8-D1-J5
Grâce au séquençage haut débit nous sommes capables de séquencer une grande population de lymphocytes d'assigner à chacun leur code et de les regrouper en clones
Le suivi de ces clones est indispensable pour traiter les patients atteints de leucémie et pour décider quelles vont être les meilleures stratégies thérapeutiques Grâce à Vidjil les laboratoires vont pouvoir suivre le clone principal détecté lors du diagnostic mais aussi suivre l'ensemble des clones et à terme espérer proposer des traitements mieux adaptés aux patients Vidjil est aussi en cours d'évaluation par un consortium européen
qui s'appelle EuroClonality Là encore le but est de voir si les méthodes d'analyse et de visualisation peuvent aider à mieux comprendre le paysage de l'ensemble des lymphocytes
Inria_853_RII_BioInfo_Bo_HD.mp4

Format : .mp4
57,2 Mo
1024 x 576 pixels
Haute définition - équivalent DVD
Encodage PAL MP4 H264
5 Mbits/s
Sélection
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