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Titre :
RII - KLAST : une nouvelle technologie de comparaison de séquences à haute performance
Légende - Résumé :
Korilog et Genscale présentent KLAST, depuis les fondements algorithmiques, jusqu'à ses applications en analyse de données de séquençage de nouvelle génération.

Rencontre Inria-Industrie : Bio-informatique et outils numériques pour les produits de santé - Lyon, 11 février 2014
Nom de fichier :
Inria_856_RII_BioInfo_Genscale-FR
Titre :
RII - KLAST : une nouvelle technologie de comparaison de séquences à haute performance
Année :
2014
Durée (min) :
00:02:08
Publications :
https://videotheque.inria.fr/videotheque/doc/856
Autres versions :
Master VF : 856
Master VEN :
Autre : Lien externe :
Lien Equipe-projet :
Lien Centre de Recherche :
Mots clés :
N° master :
856
Durée :
02 min 08 sec
IsyTag :
comparaison - donnée - génomique - graphique - industriel - logiciel - module - moteur - référence - résultat
Transcription automatiqu :
l'équipe de recherche james kane spécialisé dans l'analyse des données hégémonique a développé un logiciel de comparaison de séquences qui a été transféré dans la société corinne c'est patrick durand directeur de corea lobbys qui nous présente logiciel classe un des gros problèmes en en génomique s'arrête de d'installer les ventes de référence pour utiliser enfin les comparaisons et donc qui renvoie vous permettre d'installer ses banques de faire les comparaisons performance avec classe et e d'analyser les résultats et là on va voir un exemple avec des données de
génomique environnementale avec comme objectif de comprendre les voies dégradation de des nitrates
dans les dans les rivières en bretagne
brièvement les les fonctionnalités du logiciel que vous avez un gestionnaire de projet qui va permettre aux chercheurs de d'avoir un suivi de qualité donc tous les travaux de recherche qui sont les logiciels sont conservées vous avez un module qui permet le l'installation le déploiement des banques de référence notamment à partir des instituts publics eux qui proposent de toutes ces données
vous avez évidemment le moteur classent inquiet intégrées dans notre logiciel est enfin vous avez un une série de modules
d'analyse graphique pour la restitution des résultats eu sous forme graphique conviviale pour l'utilisateur au niveau la la pertinence de l'outil pour pour les industriels la première chose évidemment c'est bien un temps
c'est la capacité du logiciels à proposer des des des facteurs d'accélération moyen de dix par rapport à la référence ont un travail qui vous prend quarante rivers trente quatre heures avec eux avec le logiciels
eux cela peut s'il décide le industrialisés dans les oeufs dans les entreprises en ce sens qu'ils répondent qu'ils sont sur des questions de calcul donc il y a des améliorations en cours sur le sur le moteur c'est tout simplement de de le rendre d'une part encore plus rapide eux dans un ordre de grandeur dont elle est encore dix fois plus vite et être capable aussi de gérer encore plus de données puisque que
les industriels notamment avec qui on travaille arrive avec de plus en plus de données
Inria_856_RII_BioInfo_Ge_HD.mp4

Format : .mp4
78,5 Mo
1024 x 576 pixels
Haute définition - équivalent DVD
Encodage PAL MP4 H264
5 Mbits/s
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