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Titre :
RII - SAMSON : Logiciel de modélisation adaptative et de simulation de nanosystèmes.
Légende - Résumé :
SAMSON est une plateforme logicielle générique pour la conception et l’étude de nanosystèmes. Les applications à la biologie, en particulier la biologie structurale, sont nombreuses, et nous présenterons par exemple la modification interactive de la structure de protéines, les possibilités d’alignement dans les cartes de densité, les algorithmes permettant la prédiction d’appariement de protéines. Avec Stéphane Redon.

Rencontre Inria-Industrie : Bio-informatique et outils numériques pour les produits de santé - Lyon, 11 février 2014
Nom de fichier :
Inria_860_RII_BioInfo_NanoD-FR
Titre :
RII - SAMSON : Logiciel de modélisation adaptative et de simulation de nanosystèmes.
Année :
2014
Durée (min) :
00:01:44
Publications :
https://videotheque.inria.fr/videotheque/doc/860
Autres versions :
Master VF : 860
Master VEN :
Autre : Lien externe :
Lien Equipe-projet :
Lien Centre de Recherche :
Mots clés :
N° master :
860
Durée :
01 min 44 sec
IsyTag :
algorithme - C' - logicielle - Nano-D - nano-objets - protéine - qu' - structural
Transcription automatiqu :
L'équipe de recherche Nano-D développe une plateforme logicielle d'aide à la conception de nano-objets pour la biologie la chimie ou la physique C'est Stéphane Redon responsable de l'équipe Nano-D qui nous présente la plate forme logicielle Samson Ce qu'on présente c'est la plateforme Samson Ce logiciel qu'on développe dans mon équipe qui est une plateforme ouverte donc qui est utilisable pour la biologie structurale et les nano-sciences et donc on présente quelques algorithmes qui sont utiles pour les industriels en biologie structurale ou dans l'industrie pharmaceutique ou pour la recherche académique Donc précisément on présente des algorithmes qui permettent de bloquer les protéines c'est à dire d'appareiller les protéines entre elles On présente des algorithmes qui permettent de déformer facilement très facilement très intuitivement des protéines pour aligner des protéines dans des cartes de densité électronique par exemple pour déplacer un boucle dans un système Tout un ensemble d'algorithmes qui reposent sur des méthodes efficaces pour interagir avec des nano-objets Une des applications industrielles ça va être d'étudier les interactions entre un médicament et une protéine Ou alors d'étudier les interactions entre les protéines donc on va essayer de prédire comment deux protéines interagissent entre-elles ou comment trois protéines interagissent entre-elles Et on a des algorithmes qui capables de déterminer la structure plausible de trois protéines qui interagiraient ensemble
Inria_860_RII_BioInfo_Na_HD.mp4

Format : .mp4
63,7 Mo
1024 x 576 pixels
Haute définition - équivalent DVD
Encodage PAL MP4 H264
5 Mbits/s
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